Не сходится цена ТТН и ТТН ЕГАИС на несколько позиций, но в суммовом количестве цена по ТТН и ЕГАИС совпадает. Есть ли какие-либо нарушения?

Да, есть.

Сведения об отгрузке в ЕГАИС формируются на основании данных товарно-транспортной накладной.

При этом поля соответствующей заявки «7. Количество, шт.» (в котором указывается количество продукции в штуках, разлитой (расфасованной) в потребительскую тару), «12. Цена с НДС, руб. коп.» и «23. Цена с НДС, руб. коп.» (в которых указывается раздельно по каждому наименованию продукции, поставляемой в соответствии с ТТН, цена за единицу продукции (штуку, декалитр), включая налог на добавленную стоимость и акциз в рублях и копейках) — заполняются оператором организации-поставщика продукции, а поля «13. Сумма с НДС, руб. коп.» и «24. Сумма с НДС, руб. коп.» (в которых указывается раздельно по каждому наименованию продукции полная стоимость поставляемой продукции) — заполняются автоматически.