Платят ли пивоварни при кафе акциз?

Да.

Объектом обложения акцизом признаются, в частности, операции по реализации на территории Российской Федерации юридическими лицами и индивидуальными предпринимателями произведенных ими подакцизных товаров.

Пиво относится к подакцизным товарам.

К производству приравнивается также и розлив пива, осуществляемый как часть общего процесса его производства в соответствии с требованиями технических регламентов и (или) другой нормативно-технической документации, которые регламентируют процесс производства в установленном законодательством Российской Федерации порядке.