Получили разрешение РАР на производство пива менее 300 тысяч декалитров в год, но более года не вели деятельности. Действует ли это разрешение?

Да, действует.

Срок действия решения о допустимости использования основного технологического оборудования для производства пива без оснащения автоматическими средствами измерения и учета объема готовой продукции нормативно не определен.

Закон допускает лишь возможность аннулирования такого решения по решению уполномоченного органа, в случаях прекращения деятельности (ликвидации) организации или превышения производственной мощности, однако к вашему случаю эти основания неприменимы, поскольку прекращение деятельности организации в данном случае законодатель отождествляет с ее ликвидацией как юридического лица.